Homoloģijas modelēšana iegūst mērķa proteīna trīsdimensiju struktūru, pamatojoties uz līdzību starp veidnes un mērķa sekvencēm, un šī metode izrādās efektīva, pētot membrānas proteīnus, kas ir grūti izkristalizēt kā GPCR, jo tas nodrošina labāku izpratni par …
Kas ir homoloģijas modelēšana un kāpēc tā ir vajadzīga?
1.2.
Homoloģijas modelēšana ir visprecīzākā skaitļošanas metode uzticamu strukturālo modeļu izveidei, un to parasti izmanto daudzos bioloģiskos lietojumos. Homoloģijas modelēšana paredz vaicājuma proteīna 3D struktūru, izmantojot veidņu proteīnu secības saskaņošanu.
Kāds ir homoloģijas modelēšanas princips?
Homoloģijas modelēšana ir pazīstama arī kā salīdzinošā modelēšana, kas paredz proteīnu struktūras, pamatojoties uz secību homoloģiju ar zināmām struktūrām. Tas ir balstīts uz principu, ka “ ja diviem proteīniem ir pietiekami liela secību līdzība, tiem, visticamāk, būs ļoti līdzīgas trīsdimensiju struktūras.”
Kāda ir laba homoloģija Modelēšana?
Ja mēs definējam "ļoti veiksmīgu homoloģijas modeli" kā tādu, kam ir <=2 Å rmsd no empīriskās struktūras, tad veidnei jābūt >=60% secības identitātei ar mērķi, lai gūtu panākumus. likme >70% Pat pie augstām secību identitātēm (60%-95%) pat vienam no desmit homoloģijas modeļiem ir rmsd >5 Å pret
Kas no tālāk norādītā ir patiess attiecībā uz homoloģijas modelēšanu?
Paskaidrojums: Kā norāda nosaukums, homoloģijas modelēšana prognozē proteīnu struktūras, pamatojoties uz sekvences homoloģiju ar zināmām struktūrām Homoloģijas modelēšana rada visu atomu modeli, kura pamatā ir saskaņošana ar šablona proteīniem.…Kļūdas, kas radušās izlīdzināšanas solī, nevar labot turpmākajās modelēšanas darbībās.
