BigWig ir faila formāts blīvu, nepārtrauktu datu attēlošanai genoma pārlūkprogrammas celiņā, kas izveidots, konvertējot no Wiggle (WIG) formāta. BigWig formāts ir aprakstīts UCSC Genome Bioinformatics tīmekļa vietnē, un Broad Institute failu formātu ceļvedis sniedz papildu informāciju.
Kas ir bigWig formāts?
BigWig formāts ir blīvu, nepārtrauktu datu attēlošanai, kas tiks attēloti kā grafiks BigWig faili sākotnēji tiek izveidoti no WIG tipa failiem, izmantojot UCSC programmu wigToBigWig. Alternatīvi bigWig failus var izveidot no bedGraph failiem, izmantojot UCSC programmu bedGraphToBigWig.
Kā izmantot bigWig failu?
Pārvietojiet jaunizveidoto bigWig failu (myBigWig.bw) uz tīmeklī pieejamu http, https vai ftp atrašanās vietu. Ielīmējiet URL pielāgotā ieraksta ievades veidlapā vai izveidojiet pielāgotu celiņu, izmantojot vienu celiņa līniju. Ielīmējiet pielāgoto trases līniju tekstlodziņā pielāgotās trases pārvaldības lapā.
Kas ir bigWig celiņš?
bigWig Tracks ir celiņi nepārtrauktiem signāliem visā genomā. Tie ir piemēroti dažādu “neapstrādātu” eksperimentu rezultātu, piemēram, ChIP-Seq signālu, RNA-Seq signālu utt., parādīšanai.
Kā izveidot bigWig failu?
Ir vairāki veidi, kā ģenerēt lielus failus. Tas parasti ietver konvertēšanu. bam failu kustēšanās celiņā (. wig) un pēc tam pārveidojot šūpošanās celiņu par bināru bigwig (.
